Khoa Cơ khí

• Bộ môn Chế tạo máy
• Bộ môn Cơ điện tử
• Bộ môn Kỹ thuật lạnh

Khoa Công nghệ thực phẩm

• Bộ môn Công nghệ chế biến
• Bộ môn Công nghệ thực phẩm
• Bộ môn Đảm bảo chất lượng và an toàn thực phẩm
• Bộ môn Kỹ thuật hóa học

Khoa Công nghệ Thông tin

• Bộ môn Hệ thống thông tin
• Bộ môn Kỹ thuật Phần mềm
• Bộ môn Mạng máy tính và Truyền thông
• Bộ môn Toán

Khoa Điện - Điện tử

• Bộ môn Kỹ thuật điện
• Bộ môn Điện tử - Tự động
• Bộ môn Vật lý

Khoa Kinh tế

• Bộ môn Quản trị kinh doanh
• Bộ môn Kinh tế học
• Bộ môn Quản lý kinh tế
• Bộ môn Thương mại
• Bộ môn Marketing

Khoa Kế toán - Tài chính

• Bộ môn Kế toán
• Bộ môn Tài chính - Ngân hàng
• Bộ môn Kiểm toán

Khoa Khoa học Xã hội và Nhân văn

• Bộ môn Lý luận chính trị
• Bộ môn Khoa học xã hội và nhân văn
• Bộ môn Luật

Khoa Kỹ thuật Giao thông

• Bộ môn Kỹ thuật tàu thủy
• Bộ môn Cơ khí động lực
• Bộ môn Kỹ thuật ô tô
• Bộ môn Khoa học hàng hải

Khoa Ngoại Ngữ

• Bộ môn Thực hành tiếng
• Bộ môn Biên - Phiên dịch

Khoa Xây dựng

• Bộ môn Kỹ thuật Xây dựng
• Bộ môn Công trình giao thông

Viện Công nghệ sinh học và Môi trường

• Bộ môn Công nghệ sinh học
• Bộ môn Kỹ thuật môi trường

Viện Khoa học và Công nghệ Khai thác thủy sản

• Bộ môn Khai thác thủy sản
• Bộ môn Quản lý thủy sản

Viện Nuôi trồng thủy sản

• Bộ môn Kỹ thuật nuôi trồng thủy sản
• Bộ môn Quản lý sức khỏe động vật thủy sản
• Trại thực nghiệm NTTS Cam Ranh
• Trại thực nghiệm nuôi cá nước ngọt Ninh Phụng

Trung tâm Giáo dục Quốc phòng và An ninh

• Bộ môn Giáo dục quốc phòng

Bộ môn Giáo dục thể chất